У відділі представлені експонати, що знайомлять з релігіями Сходу: індуїзмом, даосизмом, буддизмом (у т.ч. ламаїзмом) та ісламом.

У цьому відділі через археологічні, етнографічні матеріали та твори мистецтва показані первісні релігійні вірування; релігійні вірування східних слов'ян; етнічні релігії Давнього Єгипту, Греції, Риму.

У музеї зберігається одна з найбагатших колекцій юдаїки України, яка має значну наукову, історичну та художню цінність. 

У відділі "Раннє християнство" експонуються пам'ятки, що дозволяють висвітлити історію християнства від І до ХІ ст. н.е.

Цей відділ органічно пов’язаний з темою «Раннє християнство», оскільки Вірменська Апостольська Церква є представником сім’ї Давньосхідних Церков – другої великої складової християнства.